在行政院前瞻基础建设特别预算支持下，科技部辖下的国家实验研究院国家高速网路与计算中心拥有强大的超级电脑算力、储存、大数据资料集及DAS资料分析平台等资源。
由于政府的AI主机要促成AI代工产业的目标并非一蹴可几，在疫情严重的时刻，国家实验研究院宣布与全球基因定序领导者Illumina携手，自即日起至2021年底无偿提供专案申请者，投入新型冠状病毒之基因定序分析服务。
科技部长吴政忠表示，Illumina是国际指标性的基因定序技术领导者，科技部引进国际资源，促进公私协力，期以科技共同助力台湾抗疫工作。希望透过分析病毒的基因定序资料，进行病毒监测、传播链溯源，甚至用于疫苗开发研究。
国研院国网中心表示，2020年初COVID-19(新冠肺炎)爆发初期，第一个SARS-CoV-2病毒基因体即由Illumina定序解密，使厂商得以快速开发核酸检测(PCR)及mRNA疫苗。借由分析完整的病毒基因图谱，有助基因序列比对，确认感染者之间的关联性，并可以观察是否有新的病毒株产生，找出新的突变位点。
在科技抗疫2.0专案中，该中心提供的高速基因序列分析设备及平台运算环境，辅以Illumina提供的COVIDSeq免费分析流量，可支援国内各大基因定序实验室、基因体中心、产业界，一天最高处理6,000多个检体，让检体基因定序的研究量能大幅提升，为疫调分析、病毒演化或疫苗开发提供科学上的证据及助益。
2021年6月初，科技部长吴政忠即宣布国家建置的超级电脑台湾杉三号正式启用支援抗疫，并由国研院国网中心推出“科技抗疫2.0”专案，以升级的台湾杉系列阵容、TWCC台湾AI云、DAS资料分析和AIoT平台，邀请学研、新创与产业界用科技报国。
根据国网中心资料，“台湾杉三号”是国研院国网中心最新建置的HPC高速运算研发平台，可提供高效能平行与分散式CPU计算环境。单机速度较“台湾杉一号”快20%，总计算力则大两倍；可支援国内大型应用研发服务，从生医科学、气候变迁、环境科学，到新兴能源等计划。
至于“台湾AI云”则有运用到NVIDIA Parabricks、IBM Functional Genomics Platform、QIAGEN、 Schrodinger Full Suite等分析开发软体工具，以利加快执行次世代基因定序的工作。
